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【2026年最新】決済代行サービスの比較13選。一覧表で違いを確認

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【2026年最新】決済代行サービスの比較13選。一覧表で違いを確認

最終更新日：2026-04-20

2026-04-20T18:15:59+09:00

顧客の利便性を高め、購入機会を増やすために、決済代行サービスの利用を検討している、店舗やECサイト・通販、スクールなどを営む企業の経営者やマネージャへ。決済代行サービスの支払いの仕組みや、目的別の選び方、おすすめサービスを紹介します。

 

決済代行サービスとは？

決済代行サービスとは、事業者と決済機関との間に立ち、契約手続きやシステム連携、売上入金管理を一括して引き受けるサービスのことです。クレジットカード決済や口座振替、コンビニ決済など、様々な決済手段の総称としても用いられます。

決済代行サービスを利用することで、決済機関との窓口が一本化され、事業者が個別に決済機関と契約・接続を行うといった、導入・運用にかかる負荷を削減。加えて、消費者が希望する決済手段を網羅的に提供することで機会損失を防ぎます。

また、後払い決済の場合には売上金を保証するサービスも多く、未回収リスクを抑えつつ大口契約や新規取引を拡大できるのもメリットです。

決済代行サービスをお探しの方は、こちらからサービス紹介資料をダウンロードいただけます。

 

決済代行サービスの仕組み

決済代行サービスは、主に以下のような仕組みで決済手段を提供します。実店舗向けとオンライン向け、企業間取引向けなど、用途によって詳細は異なります。

①各種決済サービスとの契約	クレカ決済、電子マネー決済、コンビニ決済といった個別の決済会社との契約を代行。決済代行サービスを介して、複数の決済会社を利用できる
②システム・端末連携	決済手段に応じたシステムの導入・構築を行う。店舗向けには、クレジットカード、電子マネー、QRコードといった多様な決済手段に1台で対応できる「オールインワン端末」を提供する
③実店舗での決済サービス提供	クラウドPOSレジと端末を連動させることで、金額の自動連携やスピーディーな会計を実現。4G通信を内蔵している端末なら、屋外やデリバリーでも利用可能だ
④売上管理	実店舗とネットショップ（EC）の売上をシステム上で一元管理。店舗全体のキャッシュフローが把握しやすくなる
⑤入金サイクル	複数の決済手段の売上が代行会社によってまとめられ、決まったサイクル（月数回や最短翌日など）で一括入金される。入金サイクルは決済サービスによって異なり、複数のサイクルから選べるものも

 

決済代行サービスの目的別の選び方

決済代行サービスには様々な種類があります。導入を検討する際には、「何のために決済を使用するのか」という目的を明確にしましょう。多くのサービスが幅広い決済手段に対応していますが、サービスの強みや運用フローに応じて、主に以下の5つの選び方があります。

1.クレジットカード決済を導入したい（店舗やオンライン）

店舗やECサイトなどでクレジットカード決済を導入したい場合におすすめのタイプ。店舗の場合は決済端末を用いて、オンラインの場合は決済代行サービスのシステムと連携させて導入できます。

たとえば「ペイジェント」は、サービス側が用意した決済画面のURLをメール送信するだけで決済が可能に。ECサイトへのシステム連携が不要で、スピーディーにクレジットカード決済を導入できます。

クレジットカード決済代行については、「クレジットカード決済代行会社の比較14選。違いや選び方は？」でも紹介しています。詳しく知りたい方は参考にしてみてください。

2.店舗でキャッシュレス決済を導入したい

店舗での支払い手段として、クレジットカードや電子マネー、QRコードなどの幅広い決済に対応したい場合におすすめのタイプ。

たとえば「PAYGATE」は、主要なキャッシュレス決済を端末1台で導入できます。POSレジ機能搭載の専用アプリや、クラウドPOSとの連携機能もあり、レジ計算から決済まで完結させることも可能です。

詳しくは「キャッシュレス決済端末比較13選。種類や選び方を無料含め紹介」でも紹介しています。

3.コンビニ決済を導入したい（オンラインや各種サービス利用）

ECサイトでの購入や月謝などの支払い手段として、コンビニ決済を利用したい場合におすすめのタイプ。クレジットカード情報を入力したくない、もしくはカードを持っていないユーザーのカゴ落ち防止にも有用です。支払いのための番号をオンラインで発行（発番）する方式と、紙の払込票を送付する方式の2種類があります。

たとえばSP.LINKSの「コンビニ決済」は、オンライン発番と払込票に対応。Eコマースや通信販売、各種会費など様々な業種・業態で利用可能です。

コンビニ収納代行サービスについては、「コンビニ収納代行サービスの比較12選。違いや選び方を紹介」で詳しく紹介しています。

4.後払い決済を導入したい（企業間向けとECサイト向け）

企業間での取引において、未回収リスクを抑えながら早期に資金を回収したい場合におすすめのタイプ。1カ月など一定期間の取引分を、月末などにまとめて支払う「掛け払い」タイプが一般的です。

たとえば「NP掛け払い」は、企業間における与信調査から代金回収までの業務をすべて代行。未入金を100%保証しており、個人事業主や中小企業に対しても、最短即時で99％の高い与信通過率を実現しています。

また、ECサイトや通販、各種サービス業などの消費者向けサービスでも、後払い決済は有用です。商品が届いた後に料金を支払うため、初めて利用する顧客の心理的なハードルを下げ、購入を促進します。決済代行サービスが売上金を保証するので、事業者側のリスクが少ないのもメリットです。

たとえば「GMO後払い」は、全国65,000店舗以上のコンビニや、郵便局、銀行などでの支払いが可能。決済時にその場で与信審査を行う「リアルタイム与信」のスピードと精度に優れ、高いCVRが見込めます。未回収リスクも100%保証しています。

企業間取引、消費者向けのそれぞれの後払い決済について、以下の記事でも詳しく紹介しています。
「BtoB後払い決済サービス比較12選。導入の流れや費用を紹介」
「【2026年版】後払い決済サービス比較16選。種類や違いは？」

5.口座振替で集金したい（継続課金事業者向け）

会費や月謝、毎月のサービス利用料などを口座からの自動引き落としで集金したい場合におすすめのタイプです。請求がない月は月額料金がかからないサービスが多く、年一回の会費請求などにもリーズナブルに導入できます。

たとえば「大阪ガスファイナンスの集金代行サービス」は、継続的な集金向けの「口座振替」と単発の回収向けの「コンビニ決済」の両方に対応。利用料無料のオンライン集金管理ツールを使用すれば、顧客登録や集金データの作成、結果照会もWeb上で完結させられます。

口座振替サービスについては、「口座振替サービス比較13選！手数料一覧やメリットを紹介」でも詳しく紹介しています。

 

決済代行サービスの比較一覧表

対応する決済手段と手数料率の比較表です。各サービスにおける、決済サービスの対応可否と、決済手数料をまとめたので、導入検討時の参考にしてください
※○…対応あり、△…オプション・一部対応、✕…対応なし、-…情報なし、ask…要問い合わせ

サービス名	クレカ決済	店舗決済	コンビニ決済	企業間後払い	EC後払い	口座振替
PGマルチペイメントサービス	○ ask	-	○ ask	-	○ 2.7%〜	○ ask
STORES 決済	○ 1.98%～	○	-	-	-	-
ペイジェント	○ ask	-	○ ask	○ 2.2%〜	○ ask	○ ask
PAYGATE	○ 1.98%〜	○	×	×	×	×
stera pack	○ 1.98%〜	○	-	-	-	-
コンビニ決済（SP.LINKS）	△ ask	△	○ ask	△ ask	-	△ ask
コンビニ収納代行サービス（電算システム）	△ 3.6%+ 10円/件	-	○ 130円/件	-	△ 2.7%〜	△ 100円/件
NP掛け払い	×	×	×	○ ask	×	×
Paid	×	×	×	○ 0.5〜3.5%+ 125円/件	×	×
GMO後払い	×	×	×	×	○ 2.7%〜	×
後払い.com	×	×	×	×	○ 2.8%〜+ 120円〜/件	×
大阪ガスファイナンスの集金代行サービス	×	×	○ ask	×	×	○ ask
口座振替サービス（リコーリース）	×	×	×	×	×	○ ask

 

主な決済代行サービス（クレジットカード決済）

PGマルチペイメントサービス（GMOペイメントゲートウェイ株式会社）

（出所：PGマルチペイメントサービス公式Webサイト）

クレジットカード決済や各種ID決済、コンビニ決済などを一括で導入・管理できる、総合オンライン決済サービス。公的機関を含む16万店舗以上の導入実績があり、複雑な決済プロセスをシンプルに統合することで、開発負荷の軽減と利便性向上を同時に実現する。
30以上の決済手段を用意しているほか、サブスクリプションに最適な継続課金機能や、購入者に決済URLを送るだけの「リンクタイプ」でのシステム構築など、多様なビジネスモデルに対応。また、クレジット業界のグローバル基準「PCI DSS」に完全準拠しており、情報漏えいや不正利用のリスクを最小限に抑えられる。

• 料金：要問い合わせ

クレカ決済	店舗決済	コンビニ決済	企業間後払い	EC後払い	口座振替
○ ask	-	○ ask	-	○ 2.7%〜	○ ask

STORES 決済（STORES株式会社）

（出所：STORES 決済公式Webサイト）

クレジットカード、電子マネー、QRコード決済に幅広く対応する決済代行サービス。国内すべての金融機関への入金が可能で、最短翌々営業日というスピーディーな入金サイクルにより、店舗のキャッシュフロー改善にも貢献する。
POSレジやネットショップ、予約システムなど、「STORES」の各種サービスとシームレスな一元管理を実現できるのも強み。加えて、端末単体で決済が完結する「スタンドアロンモード」と、POSレジと連携する「アプリ連携モード」を、状況に応じて切り替えられる。無料プランもあるが、決済端末は購入が必要な点に注意。

• 料金：月額3,000円+ 決済手数料（スタンダードプランの場合）　※決済端末1台を無料リース

クレカ決済	店舗決済	コンビニ決済	企業間後払い	EC後払い	口座振替
○ 1.98%～	○	-	-	-	-

ペイジェント（株式会社ペイジェント）

（出所：ペイジェント公式Webサイト）

多彩な決済手段をワンストップで提供する決済代行サービス。クレジットカードやコンビニ決済、キャリア決済に加え、コード決済や銀行振込（仮想口座方式）、企業間決済など、多様な支払いニーズに一括で対応できる。
主要なECパッケージと多数連携しており、ネットショップ構築に強みを持っている。締日から最短5営業日で入金される早期入金サイクルにより、キャッシュフローを改善し、事業の成長スピードを加速させられる。国際セキュリティ基準「PCI DSS」に準拠した安全なシステム環境も特徴。

• 料金：要問い合わせ

クレカ決済	店舗決済	コンビニ決済	企業間後払い	EC後払い	口座振替
○ ask	-	○ ask	○ 2.2%〜	○ ask	○ ask

 

主な決済代行サービス（店舗向けキャッシュレス決済）

PAYGATE（株式会社スマレジ）

（出所：PAYGATE公式Webサイト）

主要なクレジットカード、電子マネー、QRコード決済に、端末1台で対応できるマルチ決済サービス。端末はプリンター内蔵かつポータブル型で、持ち運びが可能。Wi-Fi通信と4G回線に対応しているため、店内・店外を問わず会計ができ、移動販売や屋外イベント、客席でのテーブル会計など、様々な運用方法に対応する。
また、クラウドPOSレジ「スマレジ」とのシステム連携が可能。金額の二度打ちといった入力ミスを防止する。端末内にレジ機能を搭載した専用アプリ「PAYGATE POS」を利用すれば、1台でレジ計算から決済、レシート発行までを完結できる。

• 料金：月額3,000円 + 決済手数料

クレカ決済	店舗決済	コンビニ決済	企業間後払い	EC後払い	口座振替
○ 1.98%〜	○	×	×	×	×

stera pack（SMBC GMO PAYMENT株式会社）

（出所：stera pack公式Webサイト）

クレジットカード、電子マネー、QRコードなど30種類以上の決済手段に対応できる、オールインワン決済端末。スタッフ・お客様双方が確認できる「2画面設計」と直感的なタッチパネル操作により、スピーディーな会計オペレーションを実現する。
暗証番号ののぞき見防止や電子サイン対応セキュリティ機能が充実。加えて、24時間365日のサポート体制や選べる入金サイクルなど手厚い運用支援体制を提供している。特定の売上規模に応じたサービス利用料の優遇もあり、コストを抑えつつ質の高い接客環境を構築したい店舗に最適だ。

• 料金：月額3,000円 + 決済手数料（スモールビジネスプランの場合）

クレカ決済	店舗決済	コンビニ決済	企業間後払い	EC後払い	口座振替
○ 1.98%〜	○	-	-	-	-

 

主な決済代行サービス（コンビニ決済）

コンビニ決済（SP.LINKS株式会社）

（出所：コンビニ決済公式Webサイト）

24時間365日いつでも店頭で支払いが可能な決済サービス。運用スタイルに合わせて、ペーパーレスで決済番号を即時表示する「オンライン発番」と、商品同梱や手渡しに最適な「払込票」の2タイプを提供している。
オンライン発番タイプは、画面上に決済番号を即時表示するため、発行コストを抑えたスピーディーな取引を実現。一方、払込票タイプは商品への同梱や店頭での手渡しに便利で、オンラインに不慣れな層にも案内しやすい。自社での印刷・郵送だけでなく作成代行オプションも用意されている。また、EC-CUBEやWelcartといった主要なECカートとの連携に対応。

• 料金：要問い合わせ

クレカ決済	店舗決済	コンビニ決済	企業間後払い	EC後払い	口座振替
△ ask	△	○ ask	△ ask	-	△ ask

コンビニ収納代行サービス（株式会社電算システム）

（出所：コンビニ収納代行サービス公式Webサイト）

50年以上の歴史を持つ決済・収納代行のパイオニアによる回収サービス。全国65,000店舗以上のコンビニやドラッグストアが支払窓口となり、24時間365日いつでも支払いに対応。エンドユーザーの支払いがなかった月は、月額料金が発生しない。
金銭信託による確実な資金保全体制を構築しており、小規模事業者、自治体、大手ECサイトなどあらゆる業種・業態で安全かつ効率的な回収インフラを構築できる。更に、払込票の作成・郵送を代行する「請求書作成代行サービス」や、バーコードをスマホで読み取る「アプリ払込票決済」など、事務負担を軽減するための多彩なオプションを用意している。

• 料金：月額15,000円＋コンビニ取扱手数料130円/件＋振込事務手数料500円/回　※1件あたりの取扱上限金額は30万円

クレカ決済	店舗決済	コンビニ決済	企業間後払い	EC後払い	口座振替
△ 3.6%+10円/件	-	○ 130円/件	-	△ 2.7%〜	△ 100円/件

 

主な決済代行サービス（企業間向け後払い決済）

NP掛け払い（株式会社ネットプロテクションズ）

（出所：NP掛け払い公式Webサイト）

与信から請求書発行、督促、代金回収までの決済プロセスをすべて代行する、企業間後払い決済サービス。未入金は100%保証される。独自の与信システムにより、個人事業主や中小企業に対しても最短即時で99％の高い与信通過率を実現。既存の運用フローを大きく変えずに、最短10営業日ほどでのスピード導入が可能だ。
銀行振込、口座振替、コンビニ払いといった多彩な支払い手段を備え、特別な書類手続きも不要なため、スムーズに取引を開始できる。インボイス制度や電子帳簿保存法にも準拠。少額かつ大量の請求が発生する事業や、未入金リスクを気にせず新規販路を拡大したい場合にも利用しやすい。

• 料金：月額12,000円〜　※手数料は別途

クレカ決済	店舗決済	コンビニ決済	企業間後払い	EC後払い	口座振替
×	×	×	○ ask	×	×

Paid（株式会社ラクーンフィナンシャル）

（出所：Paid公式Webサイト）

企業間取引における請求業務をトータルに代行する、未回収保証型の決済プラットフォーム。支払い遅延や貸し倒れが発生した場合でも、代金を100％保証する強固なリスク管理体制が特徴だ。
最大5,000万円という高額な限度額設定も可能で、未回収リスクを気にすることなく、新規販路の拡大や大口取引の獲得に挑戦できる。支払い方法は「銀行振込」「口座振替（自動引き落とし）」「コンビニ払い」から選択でき、すでにPaid会員の企業であれば、手続き不要ですぐに取引を始められる。管理画面からのデータ登録だけでなく、API連携や定額自動請求機能による、運用の自動化も可能。

• 料金：保証料＋事務手数料125円/件

クレカ決済	店舗決済	コンビニ決済	企業間後払い	EC後払い	口座振替
×	×	×	○ 0.5〜3.5%+ 125円/件	×	×

 

主な決済代行サービス（ECサイト向け後払い決済）

GMO後払い（GMOペイメントサービス株式会社）

（出所：GMO後払い公式Webサイト）

決済業界のリーディングカンパニーが運営する、信頼性の高い後払い決済サービス。請求書発行や督促、入金管理といった煩雑な請求業務をすべて代行し、未回収リスクを100％保証。購入者は商品を受け取った後に、コンビニや銀行、郵便局などで代金を支払えるため、購買意欲を逃さない。
決済時にその場で審査結果を回答する「リアルタイム与信」のスピードと正確性が強み。豊富な実績と蓄積された膨大な不正データ、独自のアルゴリズムを活用することで、購入者を待たせないスムーズな購買体験を実現する。

• 料金：手数料＋請求書発行費用

クレカ決済	店舗決済	コンビニ決済	企業間後払い	EC後払い	口座振替
×	×	×	×	○ 2.7%〜	×

後払い.com（株式会社キャッチボール）

（出所：後払い.com公式Webサイト）

導入店舗数30,000以上という実績を持つ、後払い決済代行サービス。与信審査から請求書発行、代金回収、入金管理、更には未払い時の督促にいたるまで、後払いに関する工程を丸ごと代行。加えて、代金を100％保証する。
購入者が商品を受け取った後に、コンビニや郵便局、銀行などで代金を支払う仕組みにより、初めての利用者にも安心感を与えられる。リアルタイム与信は数秒しかかからないので、購買体験を損なわない。また、累計利用金額に一律の上限設定を設けていないため、ギフト注文や高額商品のまとめ買い、法人による大口注文など、幅広いニーズを取り込める。

• 料金：月額9,500円 + 決済手数料（スタンダードプランの場合）

クレカ決済	店舗決済	コンビニ決済	企業間後払い	EC後払い	口座振替
×	×	×	×	○ 2.8%〜+ 120円〜/件	×

 

主な決済代行サービス（口座振替）

大阪ガスファイナンスの集金代行サービス（大阪ガスファイナンス株式会社）

（出所：大阪ガスファイナンスの集金代行サービス公式Webサイト）

集金代行業務歴30年以上・年間141万件という豊富な実績を持つ総合集金代行サービス。継続的な集金に最適な「口座振替」と、単発の回収に便利な「コンビニ決済」の2種類を備え、企業の回収ニーズに対応する。月額料金は実際に利用した月のみ発生。
無料で提供しているオンライン集金管理ツール「あつ丸」を使用すれば、顧客登録や集金データの作成、結果照会などすべての工程をWeb上で完結できる。また、印鑑や書類の手続きを不要にする「WEB口座振替受付サービス」などのオプションも便利。

• 料金：月額3,000円 + 決済手数料（口座振替代行サービスの場合）

クレカ決済	店舗決済	コンビニ決済	企業間後払い	EC後払い	口座振替
×	×	○ ask	×	×	○ ask

口座振替サービス（リコーリース株式会社）

（出所：口座振替サービス公式Webサイト）

習い事の月謝や介護利用料、各種会費などの、定期的な回収業務を効率化する口座振替サービス。全国の都市銀行や地方銀行だけでなく、ゆうちょ銀行やネット銀行まで、多くの金融機関から自動引き落としが可能。請求がない月は月額料金がかからないため、リーズナブルに導入できる。
専用ソフトの導入は不要で、インターネットに接続できる環境があれば、Webサイトから簡単に請求データの作成や結果照会を行える。また、紙の依頼書を使わずにスマホやPCで登録が完結する「ネット口座振替受付」や、キャッシュカードと暗証番号だけでその場で手続きが完了する「ペイジー口座振替受付」など、有償オプションも充実。

• 料金：要問い合わせ

クレカ決済	店舗決済	コンビニ決済	企業間後払い	EC後払い	口座振替
×	×	×	×	×	○ ask

 

まとめ

決済代行サービスとは、事業者と決済期間の仲介をし、契約手続きやシステム連携などを代行するサービスです。クレジットカード決済や口座振替、コンビニ決済などの各種決済手段を手軽に導入できます。

大きく分けて、店舗の対面決済を前提としたサービスと、ECサイトなどのオンライン決済を前提としたサービスの2種類があり、対応している決済方法によって利用シーンも異なります。決済代行サービスを導入する際は、以下のような目的別に最適なサービスを選びましょう。

• 店舗やECサイトでクレジットカードを導入したい
• 店舗でキャッシュレス決済を導入したい
• ECサイトでの購入や月謝などの支払い手段としてコンビニ決済を導入したい
• 企業間取引やECサイトにおいて後払い決済を導入したい
• 継続課金事業において口座振替で集金を効率化したい

それぞれのタイプを個別に紹介した記事もあるため、より詳しく知りたい場合には本記事と合わせて参考にしてください。決済代行サービスを導入すれば、顧客の満足度を高めるとともに、業務負担や未回収リスクを軽減できます。この機会に導入を検討してみてください。

決済代行サービスをお探しの方は、こちらからサービス紹介資料をダウンロードいただけます。

 

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